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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>/ q% a) o3 Q0 d
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>- ?3 U g: U( Y9 n
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相关讨论
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>* z# K6 a3 E- M" l- o$ p
</li>
6 C8 [7 w* @ O' y% @& n) U& r9 j( Z. m<li>
p# } D% F/ f) q" F; y另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
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! l& l: Q. u1 ^6 ? O2 a1 A<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
0 U3 z( i7 V' B x' K1 y: g<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>) \" c* ?5 E3 }; n( ~/ a$ _4 }
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>- v: k3 _! Z( Q; U9 v. _2 C0 K- j/ Z
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>% Y1 z+ r1 Q- }8 D
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% R$ C+ l) r# G! t5 H2 [, t<li>/ G$ u, ^. K# t: _: p& E
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。6 w& Z% ?5 |4 Z7 w
</li>9 r- ^& i& v8 J, ?
<li>
. }7 i$ [+ s2 T@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。6 B9 c/ G+ N& W' ?( v4 l7 p2 b
</li>
7 e3 q: e- z; g/ g; m0 P1 B8 L% j<li>
1 {' d- n+ v# Z8 V! A& {这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。$ A0 V1 y* I, z( T
</li>
9 _3 V$ ]- i7 F4 ~" {* i<li>
4 c8 \& G6 c, U$ [ |# [: G是的，这很完美。非常感谢！
# A9 `' z9 N# `, F- @</li>9 u+ l" u" u6 b+ k* d
<li>
* r* f3 g& k' h" ~4 ^0 V/ M@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>, |6 |7 L3 p. E( Z
</ul>9 F: p' b; V/ d) k' n2 N
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<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>) d s" ~: E! G( w; P! o# e! Q
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>2 N" |9 n7 R! @7 \# x- u
<p><center> </center></p> C2 e# c6 r' D
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>. B) p4 K! q5 b1 A( W
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p># L7 S1 i9 k! M9 \# q
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<ul>' K( T' k- Q$ J8 `" A4 V2 \+ O! G
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.% N. n9 v! A' u# C6 h/ V' ~) [& o
</li>9 b8 v* b# V; X
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8 q' V$ w, @! D1 B3 F链接现在失效了。( R# \. f3 M3 a9 s9 i# c9 `% Y
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! P2 o! l' o! D) v+ e4 U' M% h q这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/..., L G4 E5 X) y2 M
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发表于 2022-2-12 18:18:47