R：在 RStudio 中，我如何将 knitr 输出到不同的文件夹以避免弄乱我的驱动器？ ...

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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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<p><center> </center></p>
1 F5 F  _& ]0 s: w+ F0 n: J8 E<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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<ul>
0 H$ U& X* B8 ]2 Y! s1 Z; x0 y<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
</li>
<li>
* v- z: z7 Y. H% ?8 z( ^另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
</ul>
<p></p></div>
( @1 M$ S' u0 j        </div><p></p></div>
<hr>
6 f7 k% m+ u; o1 y$ v<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
" K+ U$ z# E8 h' c# n<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>
  rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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2 v$ y- N: e: G. S2 t- C! w<ul>
<li>
$ E) n1 b8 {" G; N  g/ J0 b这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
</li>
6 l; |7 o) j0 d/ u<li>
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
* [  \8 T, v4 p</li>
" S+ |, r% T% z8 Z9 B<li>
) ]8 U; y9 Y$ \  p: z这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。
</li>
6 h  F1 T" p0 N- B<li>
是的，这很完美。非常感谢！
$ W7 z/ |5 _  |5 }* ]</li>
( H/ V9 ^5 D5 ?( d! O$ V* W<li>
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>
) l) ?9 ^' L: X" D</ul>
9 X9 P# b, W; j. w' N8 I<p></p></div>
; ~* c# c. Z; ^& C7 t        </div><p></p></div>
<hr>
<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
- f9 v' Q5 R& |4 m) f- ^<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
<p><center> </center></p>
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
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" g4 p" M: z: c6 A$ T<ul>
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
4 G% a! J- b- b) ^4 Y</li>
<li>
  k, v2 d1 a5 M' }8 @/ R链接现在失效了。
</li>
<li>
这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
</li>
( M; S% p3 i$ u) t</ul>
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