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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2># C( j" u' @7 e8 A8 w2 h. R2 n& l0 S$ @
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>% [2 ?, O" ~0 W b7 O7 {" B2 h
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相关讨论
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' U6 b# G4 y, l" S- u! w2 Z<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
! ?5 \* M7 z% g</li>. T5 F+ P' d2 G+ W2 |* r( {
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; k& Y1 ^4 T1 d2 Q4 \4 A另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>$ b) d1 b' r* K0 p/ E( I
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. ~5 L) H" J2 F# L. a+ S2 A8 e<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>
2 l( m* ?5 |6 L+ [1 {( X5 X<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>/ {- E) b: }7 h1 R' o) \6 P" L1 U
<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>; v+ x/ b# Y K9 _# q- q
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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<div class="xContent" style="display: none;"><p></p>0 O/ s" H3 j* o; Q
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! N0 t9 W& u+ P" h3 Q4 P<li>
% k6 G$ y% i8 c- u这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
. O+ g* }9 X8 m7 ]</li>
Y4 Y, g7 p- C: \% x+ f! ?5 t8 C<li>
$ {& z1 W& f: G/ n; x. X@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。, Z4 S1 v7 N* i/ @( E' U
</li>
( g' a; \, I8 p# @" ~2 P<li>
$ j# O4 ]( I, Y, E+ e; }这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。/ S# m/ L9 ?6 H/ L
</li>
+ O6 s B" x8 r<li>
& c/ A% f; Q: D9 q! L+ r是的，这很完美。非常感谢！# T0 r8 v5 m6 a5 b( s. o0 S
</li>
* P* g, r. S1 p' K! H<li>3 m3 c. i3 _$ o; n1 a
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>0 O! w+ Q- g; V, U- ^
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/ Z' @3 U/ O6 ^<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>( S' u1 e q# j; M6 | h9 T; h
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
' [, Y: q E5 s/ ?3 `<p><center> </center></p>
- \. a9 o3 q( k; Y<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>
1 e0 M8 V, M! r6 o* R( E( R& _, z/ h<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>, \' b7 P5 L: Y/ t
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& Y; P1 D+ }1 p5 Z# } <div class="xControl"><i class="fa fa-caret-right"></i>& ?- k% T8 J2 p. x, R" C
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" I) e; ?; L. g2 j" q* U) f <div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
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<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.) g- w1 ? r$ E7 H3 p7 N$ c
</li>6 k0 d5 i0 t; m2 b
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链接现在失效了。/ R; E" J& c- F/ ~
</li>
: H4 |) `) [9 W# e( E S& K4 b. t0 }<li>
- Q2 n0 y% @# ?这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...- s' J% V+ P1 U5 y0 Y1 F5 k
</li>5 j) t1 j0 j7 R6 k. p0 ^- U
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发表于 2022-2-12 18:18:47