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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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i, I! s- [8 u; U<p><center> </center></p>+ ]& V+ N* y! n! L5 n4 ?
<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>5 w" {5 }2 F& d+ \2 \" k# e( @
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<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>- c: v; ^% m; ^) h8 ^/ g0 [
</li> F" }' K, i; Q' I
<li>
, [* C2 l. f- ^5 q/ o, N: t另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
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<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>$ {5 }2 Q6 A6 d7 Q1 J* {9 O8 d
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
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rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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<li>$ v- {" `4 s# b7 g B+ w4 c
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。
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: S" F7 z( ]+ V5 m<li>" J0 Q$ R# D! V+ V0 B( A& R
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
0 o* c" H3 {! d0 e$ k) Y" [3 t2 w</li>2 a9 u \4 `+ C2 V
<li>
7 }# N# }% V- t9 N2 z+ |5 Z这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。- a. l5 \( g4 F M t; d) L
</li>8 N0 Q2 I& v# |8 y# G$ b
<li>1 I8 a- _- U3 ~0 j2 N8 F, ^
是的，这很完美。非常感谢！# r. n+ F J* ~7 N
</li>
1 V3 D9 x0 h$ C; B<li>9 a' |& s( B+ }1 r9 q4 Q# X( M
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>7 T/ T. `# m: q7 _6 O' F) H& ]
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- K% E9 x- b; z<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>
. K% j* w" l8 Y6 {+ ^* E<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>, f( g, b0 z3 P- @
<p><center> </center></p>
5 s; A" I2 T' t<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>' i; t" S) K1 C! O
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>
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( `# }, q- T6 Q6 n' B. \<ul>3 G6 H" q% I- f$ s- ]. M
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
' c: d2 N+ v: P' E0 ^- D</li>
/ j. @# `4 `" }; N+ \! N<li>- W9 }9 G8 k6 ?+ c
链接现在失效了。
0 Q% J; D- Y9 f% U& P+ O</li>
5 K5 r. v ]! ]1 o4 [7 z) N( B7 r& l! K<li>
: u- C5 [. B& s3 n这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/..." ^& @ b2 _9 Y5 \
</li>
. ~ ^/ @' w5 U: t; u</ul>
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发表于 2022-2-12 18:18:47