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<h2>R: In RStudio how do I make knitr output to a different folder to avoid cluttering up my drive?</h2>
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<p>我正在使用 RStudio 的 knit HTMl 函数来输出一些演示文稿。但它总是将文件输出到我当前的工作目录。如何将其输出到另一个目录，以便我的目录干净，只有原始 .rmd 文件？</p>
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3 t# e3 V4 @- X8 `' u. e# D* G 相关讨论
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<ul>
3 O7 D( X+ I6 H% T% @<li>您需要使用 knit HTML 按钮吗？如果没有，你可以做 <wyn>rmarkdown::render('my.Rmd', output_file = 'folder/my.html')</wyn>
0 l: Z& R/ {$ Y/ {</li>7 l9 O! d2 T8 p) W7 Q2 X
<li>: [4 y$ R; n v4 c7 {
另见：github.com/ropenscilabs/ezknitr</li>
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<p>Rmarkdown 中提到的将输出文件定向到目录中的技巧对我有用。</p>' g# b) C. Q! B' V
<p>示例：将以下内容添加到 YAML 前导作为顶级项，以将输出写入 <wyn>pdf/</wyn> 子目录：</p>
]7 M2 E$ P$ k4 ], u) z, b' Y* Y<div class="codecolorer-container text dawn" style="overflow:auto;white-space:nowrap;width:100%;"><table cellspacing="0" cellpadding="0"><tbody><tr><td class="line-numbers"><div>1<br>2<br></div></td><td><div class="text codecolorer">knit: (function(inputFile, encoding) {<br>$ j' y; m1 U5 ?0 \" i3 \
rmarkdown::render(inputFile, encoding = encoding, output_dir ="pdf") })</div></td></tr></tbody></table></div>
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& b, z9 i: V( W/ |! R<li>% B1 D8 g6 Y) H E& g ~
这会以任何方式改变工作目录吗？我刚刚在我的prolog中添加了一个类似的片段(指定 <wyn>output_file</wyn>)，但是当我通过编织按钮编织文档时，不知何故不再找到某些对象。当我在prolog中注释掉新行时，一切正常。$ L, G( y8 Q' p- r, W
</li>
5 A6 b: G* w0 W4 M" I1 V<li>* y, U6 K. v! D2 `
@stats-hb：我不知道，但是您可以使用包含显示 <wyn>getwd()</wyn> 的块的文档对其进行测试。
& H; H/ k4 x# M |" p/ d2 ~' Q</li>. C" Q: P' T4 R, c9 |, A. r0 H7 C
<li>
) k/ X# b! i% {4 k: W, R/ x这对我有用，它不会改变工作目录。谢谢。4 t3 S2 n# |; _: @
</li>3 D, w% K% O& E
<li>
+ u4 r- l$ g+ x" e是的，这很完美。非常感谢！5 u; G, y4 ?5 X& r4 s
</li>
- Q# |0 n- I6 T( K. i<li>: x6 X/ p& Z, a2 v$ k' J; e( y
@stats-hb 似乎它使用了 Knitr 默认值，其中 knit 目录是 .rmd 所在的位置，即使您使用 knit 按钮旁边的下拉菜单更改了 knit 目录也是如此。我将 <wyn>knit_root_dir = rprojroot::find_rstudio_root_file()</wyn> 添加到 <wyn>render</wyn> 调用中，它可以将 knit 目录设置为项目目录</li>+ t$ R* y/ m3 c/ }
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z& J% {2 q4 n<p>正如 Eric 在评论中指出的那样，如果您愿意放弃 Knit HTML 按钮的便利性(它会生成与您的 <wyn>.Rmd</wyn> 一起存在的 HTML 文件)，您可以直接调用 <wyn>rmarkdown::render</wyn>。</p>% S) n( {- F3 h7 F6 l
<p>然而，如果你真的需要自定义你的工作流程，你可以覆盖 Knit HTML 按钮来运行你通过 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项运行的任何命令。此命令可以使用特定选项(例如输出目录)调用 rmarkdown 并执行其他预处理或后处理任务。此处的文档：</p>
# V% ~) Z" N! D& ~<p><center> </center></p>4 F3 K9 V) P& a# C: d& b! `8 S' B7 Z
<p>https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552186-Customizing-Markdown-Rendering</p>% g: [ M* z& J* y
<p>请注意，设置 <wyn>rstudio.markdownToHTML</wyn> 选项将关闭 RStudio 中一些较新的 RMarkdown V2 集成功能，因为 RStudio 将不再能够推断正在使用什么引擎来呈现文档。 </p>9 j: b8 X! a6 E7 K4 d, W' k: _" @6 M
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6 x$ z# Q3 v3 t K7 A <span class="xTitle"></span> 4 m) P4 i4 I$ Z! s7 T8 r
相关讨论
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<div class="xContent" style="display: none;"><p></p>
: b* [+ r6 Y2 `* i<ul>/ l2 f! Z1 r7 _3 F$ g
<li>我仍在为此苦苦挣扎(试图让所有中间/结果文件转到 <wyn>/output/</wyn>，我很想使用 RStudio 按钮。你能提供一个 MWE 吗？不幸的是，上面的 rstudio 文档链接是付费墙或其他东西.
: A- X# w) g2 l( A</li>
9 R) y2 N; ]/ ?<li>
* H4 M; g) B" [+ W链接现在失效了。% T2 U+ \0 q% g5 T
</li>
O6 E2 P; l+ f( Q# w<li>
- \- U; B+ I7 M& }* I1 D3 w' b2 c3 I9 a这里是存档页面：web.archive.org/web/20150920182851/https://support.rstudio.c??om/...
8 D& i( z3 G+ S6 R- |2 b</li>
% i& k+ S$ E) T- _</ul>% s8 t: g- Q0 n0 ?/ a$ N
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发表于 2022-2-12 18:18:47